Home » Témalista, 2020

Témalista, 2020

Összeszedtem, mit hol lehet megnézni. Az MS Teams csoportban is vannak anyagok és az Óravázlat 2020-ban is. További olvasnivalók itt.

Könyvek

Ajánlok néhány könyvet. (Pletykák szerint könyveket gyakran meg lehet találni neten…)

[1] Barton et al. Evolution http://www.evolution-textbook.org/

Ez a talán legkorszerűbb összefoglaló evolúció tankönyv. Az elméletibb fejezetei online találhatóak:

Chapter 27: Phylogenetic Reconstruction

Chapter 28: Models of Evolution

[2] John Maynard Smith, Eörs Szathmáry: Az evolúció nagy lépései

(Angol eredeti: The Major Transitions in Evolution.)

[3] Kun Ádám: Evolúcióbiológia.

Magyar nyelvű evolúcióbiológia tankönyv.

[5] Pásztor et al.: Theory-Based Ecology http://tbe.elte.hu/

Saját könyv, az ökológiai részekhez használható.

[6] Meszéna Doktori

Együttélés, adaptív dinamika, fajképződés.

Kvalitatív kép az evolúcióról

A sok mindent, amit meséltem összeraktam egy prezentációba: EvolucioKvalitativ.pdf

Ezt nem tudom egy rövid szöveges jegyzetben prezentálni. Például a 2018-as óravázlatot érdemes nézni arról, miről mi olvasható. És vannak a videók, az idei is, és a 2017-28-as is. Összefoglaló könyvnek [1]-et ajánlom. Kiemelem a nagy evolúciós átmenetek koncepcióját, amely a [2] könyv, és amelynek alapcikke ez:

The major evolutionary transitions

Szelekció                             

A szelekció alakvető matematikáját pedig összeszedtem egy szövegbe: Szelekcio.pdf                                                  

Ezzel akkor meg az a baj, hogy túl röviden, csak a lényeg. Sok helyen sokkal nehézkesebben van meg ennek a töredéke. Történetileg a diploid populációgenetika a szelekciós elmélet kiindulópontja. (Nagyon sok helyen megtaláljátok.) De matematikailag sokkal tisztább először is mindent felírni klonális öröklődésre. Ezután a diploid genetika erre visszavezethető – ez is le van írva a denti jegyzetbe.

(A soklókuszos genetika sajnos idén teljesen kimaradt, és nincs is róla jó szövegem. A legfontosabb ügyek: a lokuszok között átkeresztezés lehet. A sok lókusz által meghatározott kvantitatív jellemzők tipikusan Gauss-eloszlásúak a centrális határeloszlás tétel miatt.)

Járványterjedés, SIR                           

Bevezetés az alapvető modellekbe:

https://en.wikipedia.org/wiki/Compartmental_models_in_epidemiology

Magyar COVID19 modellezés:

https://research.physcon.uni-obuda.hu/COVID19MagyarEpi/

A COVID19 járvány talán leghíresebb cikke Tomas Pueyo-tól, ‘Hammer and the Dance’ címmel, amely népszerűsítette azt a képet, hogy először le kell törni a járványt, azután lent tartani, mert nyájimmunitás nem lesz:

https://medium.com/@tomaspueyo/coronavirus-the-hammer-and-the-dance-be9337092b56

https://medium.com/@tibi_9859/koronav%C3%ADrus-a-balta-meg-a-t%C3%A1nc-400cdf3b254

Legfrissebb elemzés az Imperial College-ból arról, hogy a terjedési klasztereket kell elsősorban kontrolálni:

https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/report-25-south-korea/

Ezen kívül egy csomó linket összegyűjtöttem a járványról itt még az elején, ezt nem frissítettem folyamatosan.

Kompetitív kizárás,együttélés, Lotka-Volterra egyenlet

Itt az a lényeg, hogy ha különböző fajok növekedése különböző korlátokba ütközik, akkor lecsökken közöttük a versengés. Ilyenkor előny származik a ritkaságból, és a fajok együtt tudnak élni.

[5] könyv, 9. fejezet, főleg az elméleti blokkok.

Génhelyettesítés sztochasztikus elmélete, molekuláris evolúció                           

Lévén hogy ez egy matematikailag nehezebb rész, van róla két összefoglaló, az egyik szöveg, másik prezentáció: neutral5.pdf, Valoszinusegi.pdf

Ez csak a matematikai tárgyalás, a legfontosabb eredmény a neutrális evolúció és a genetikai óra. Mutogattam molekuláris leszármazási fákat, ezeket beletettem a fent EvolúcióKvalitatív.pdf-be. Az [1] könyv fent belinkelt 27. (online) fejezete bővebb kitekintés a terület matematikájára. A terület nagyon gyorsan fejlődik, Szöllősi Gergelyék honlapja betekintés az élvonalba:

http://ssolo.web.elte.hu/

Adaptív dinamika, fajképződés               

Doktori.pdf

Reproduce with whom?

Játékelmélet

Berta Dénes most írt egy jó összefoglalót:

http://gezameszena.web.elte.hu/wp-content/pdf/ElmEvol/Game_theory.pdf